Next Generation Sequencing

Le modèle est structuré autour de six piliers : la préparation de la banque, l'amplification clonale, le séquençage en temps réel (protons ou photons), l'analyse bio-informatique des données, les types de détection (mutations, indels) et une comparaison avec la méthode Sanger.

Consultez la branche Analyse de données pour voir comment le logiciel regroupe les index des patients et aligne les séquences. Le modèle définit spécifiquement la « Profondeur » comme le nombre de fragments alignés et la « Couverture » comme le seuil pour observer une mutation.

Oui, ce modèle est entièrement personnalisable. Vous pouvez ajouter vos propres protocoles de laboratoire, modifier les étapes de fragmentation ou enrichir la section bio-informatique avec des outils spécifiques comme GATK ou BWA.

Le modèle souligne que le SANGER produit des fragments plus grands et plus précis pour les séquences répétées, tandis que le NGS offre un débit plus important, utilise moins de réactifs et traite des millions de répétitions simultanément.